Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm5478D3Z6R0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Gm5478D3Z6R0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm5478D3Z6R0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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