Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Rd3lB2RV38 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rd3lB2RV38 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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