Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms