Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H2-M5A7VMS3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
H2-M5A7VMS3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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