Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3238W4VSP7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3238W4VSP7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3238W4VSP7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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