Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp5Q9Z2P8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vamp5Q9Z2P8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms