Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rps6ka4Q9Z2B9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rps6ka4Q9Z2B9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rps6ka4Q9Z2B9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms