Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uso1Q9Z1Z0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uso1Q9Z1Z0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uso1Q9Z1Z0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms