Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ap3b1Q9Z1T1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Ap3b1Q9Z1T1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ap3b1Q9Z1T1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ap3b1Q9Z1T1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms