Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lgr5Q9Z1P4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lgr5Q9Z1P4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms