Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L4

Rs1, Retinoschisin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rs1Q9Z1L4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rs1Q9Z1L4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rs1Q9Z1L4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms