Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nek4Q9Z1J2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nek4Q9Z1J2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms