Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf394Q9Z1D9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf394Q9Z1D9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znf394Q9Z1D9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znf394Q9Z1D9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms