Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cog1Q9Z160 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cog1Q9Z160 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms