Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl8Q9Z121 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl8Q9Z121 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms