Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hmg20bQ9Z104 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hmg20bQ9Z104 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms