Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVS6

Prkn, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrknQ9WVS6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PrknQ9WVS6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PrknQ9WVS6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrknQ9WVS6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms