Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pmfbp1Q9WVQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms