Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVJ9

Efemp2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp2Q9WVJ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efemp2Q9WVJ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Efemp2Q9WVJ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efemp2Q9WVJ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms