Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slit3Q9WVB4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slit3Q9WVB4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slit3Q9WVB4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Slit3Q9WVB4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms