Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CcsQ9WU84 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CcsQ9WU84 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms