Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfsf13bQ9WU72 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf13bQ9WU72 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf13bQ9WU72 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms