Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp18Q9WTV6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp18Q9WTV6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp18Q9WTV6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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