Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ggps1Q9WTN0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ggps1Q9WTN0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ggps1Q9WTN0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms