Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Fam50bQ9WTJ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fam50bQ9WTJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fam50bQ9WTJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms