Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sorbs3Q9R1Z8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sorbs3Q9R1Z8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sorbs3Q9R1Z8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms