Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmed2Q9R0Q3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed2Q9R0Q3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed2Q9R0Q3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms