Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NrkQ9R0G8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.8■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.77■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
NrkQ9R0G8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NrkQ9R0G8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NrkQ9R0G8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms