Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Wdr54Q9R0D8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Wdr54Q9R0D8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Wdr54Q9R0D8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms