Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vav3Q9R0C8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vav3Q9R0C8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vav3Q9R0C8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms