Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lamc3Q9R0B6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Lamc3Q9R0B6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lamc3Q9R0B6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lamc3Q9R0B6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lamc3Q9R0B6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms