Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CtsfQ9R013 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CtsfQ9R013 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtsfQ9R013 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms