Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphs1Q9QZS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nphs1Q9QZS7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nphs1Q9QZS7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nphs1Q9QZS7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nphs1Q9QZS7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms