Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf25Q9QZR0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf25Q9QZR0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf25Q9QZR0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf25Q9QZR0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf25Q9QZR0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf25Q9QZR0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf25Q9QZR0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf25Q9QZR0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf25Q9QZR0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms