Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms