Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp21Q9QZL6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp21Q9QZL6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp21Q9QZL6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms