Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Copg1Q9QZE5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg1Q9QZE5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg1Q9QZE5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms