Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tomm40Q9QYA2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm40Q9QYA2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms