Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Opn4Q9QXZ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Opn4Q9QXZ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Opn4Q9QXZ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms