Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nr2e3Q9QXZ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nr2e3Q9QXZ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr2e3Q9QXZ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms