Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Apbb1Q9QXJ1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Apbb1Q9QXJ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apbb1Q9QXJ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms