Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Limd1Q9QXD8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Limd1Q9QXD8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Limd1Q9QXD8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms