Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chaf1aQ9QWF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chaf1aQ9QWF0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chaf1aQ9QWF0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms