Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cln8Q9QUK3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cln8Q9QUK3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cln8Q9QUK3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms