Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csnk1eQ9JMK2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csnk1eQ9JMK2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms