Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hdgfl3Q9JMG7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hdgfl3Q9JMG7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms