Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b2Q9JME5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ap3b2Q9JME5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ap3b2Q9JME5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ap3b2Q9JME5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ap3b2Q9JME5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms