Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB8

Cntn6, Contactin-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn6Q9JMB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntn6Q9JMB8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cntn6Q9JMB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cntn6Q9JMB8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms