Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cul3Q9JLV5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cul3Q9JLV5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cul3Q9JLV5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms