Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Higd1aQ9JLR9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Higd1aQ9JLR9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Higd1aQ9JLR9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 523.4 ms